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Responsabili di Laboratorio e Senior Researchers
Dott.ssa Manuela Vecchi
Responsabile Area Medical Genomics e Senior Researcher
La dott.ssa Manuela Vecchi è una ricercatrice con molti anni di esperienza nella conduzione di progetti scientifici multidisciplinari, dalla genomica alla medicina di precisione in oncologia.
Dopo la laurea in Scienze Biologiche e il diploma di specializzazione in Biochimica e Chimica Clinica presso l'Università di Firenze, ha lavorato per circa 3 anni presso il Dipartimento di Biochimica della Vanderbilt University (USA) dove ha contribuito allo studio dei meccanismi di regolazione degli EGFR (Epithelial Growth Factor Receptors), oggi importanti bersagli molecolari in oncologia. Successivamente ha continuato la sua ricerca oncologica a Milano, inizialmente presso il Dipartimento di Oncologia Sperimentale dello IEO (Istituto Europeo di Oncologia) e successivamente presso l'IFOM (Istituto FIRC di Oncologia Molecolare), dove le è stato assegnato il ruolo di Staff Scientist. Per otto anni ha diretto il Laboratorio di biomarcatori clinici, nell'ambito del programma di medicina traslazionale dello IEO di Milano. Lavorando a stretto contatto con le divisioni cliniche e i ricercatori, si è occupata dell'identificazione e della validazione preclinica e clinica di nuovi biomarcatori tumorali in specifiche coorti di pazienti mediante studi retrospettivi e prospettici. Ha lavorato per Cogentech S.r.l., una società di beneficienza IFOM che offre sia servizi ad alta tecnologia per la comunità scientifica sia servizi di diagnostica dei tumori ereditari per i clinici, e si è occupata dell'avanzamento del portafoglio diagnostico dell'azienda e dello sviluppo di basi NGS.
Nell'ambito del progetto 5000genomi@VdA, la dott.ssa Vecchi coordina il team di genomica medica che si occupa della raccolta, conservazione ed elaborazione dei campioni biologici e del sequenziamento del genoma umano: queste attività sono fondamentali per la costruzione di una banca dati integrata con dati clinici e genomici relativi a malattie del neurosviluppo, neurodegenerative e oncologiche. Inoltre, ricopre un ruolo multisettoriale lavorando con medici, ricercatori e bioinformatici per consolidare collaborazioni proficue con l'Ospedale U. Parini e i vari partner del progetto.
Dott. Alessandro Coppe
Responsabile Area Computational Genomics e Senior Researcher
Il dottor Alessandro Coppe si è laureato in Scienze Biologiche nel 2003 presso l'Università di Padova, dove ha conseguito anche il dottorato di ricerca in Bioscienze con specializzazione in Genetica e Biologia Molecolare dello Sviluppo. Grazie al suo interesse per l'informatica e la programmazione, oltre che per la biologia, ha trovato nella bioinformatica il suo campo di ricerca ideale, a partire dalla sua tesi di laurea. Inizialmente ha lavorato all'identificazione dei siti di legame dei fattori trascrizionali (TF-BS) situati nei promotori di geni co-espressi in varie parti del corpo umano. Dal 2006, quando si è consolidato l'uso del sequenziamento di nuova generazione (NGS), ha iniziato a lavorare sull'analisi dei dati provenienti dall'unico sequenziatore NGS disponibile all'epoca, il sequenziatore 454. In particolare, si è concentrato sull'analisi dei genomi di specie animali considerate importanti dal punto di vista ambientale e/o economico. Nel 2013 è passato all'analisi dei dati Illumina, occupandosi dello studio dei tumori, principalmente della leucemia infantile. Nel corso della sua carriera, ha sviluppato numerosi programmi software dedicati all'analisi dei genomi tumorali o all'identificazione di specifiche caratteristiche genomiche di notevole importanza biologica.
Il ruolo del dottor Coppe all'interno del progetto 5000genomi@VdA è il coordinamento del team bioinformatico, con l'obiettivo di sviluppare pipeline per l'analisi dei genomi sequenziati al fine di identificare caratteristiche specifiche del genoma di riferimento dei valdostani. Inoltre, è coinvolto nell'analisi dei dati ottenuti dai tumori per facilitare il lavoro degli oncologi, identificando le alterazioni genetiche che possono essere trattate con farmaci specifici.